W okresie zarówno I jak i II wojny światowej Strzepcz wraz z całą parafią był świadkiem wielu działań wojsk zarówno polskich, jak i niemieckich. Wynikało to z jego przygranicznego położenia. Znamiennym elementem historii był fakt, iż pod koniec II wojny światowej w okolicy wsi przechodzili więźniowie obozu koncentracyjnego Stutthof, uczestniczący w tzw. Marszu śmierci. Na miejscowym cmentarzu znajduje się grób 75 uczestników tego marszu. Natomiast w marcu 1945 roku na Ziemię Strzepską wkroczyli sowieci, którzy rabowali dosłownie wszystko. Do tego dochodziła przemoc i gwałty na ludności.
W czasie II wojny światowej kościół w Strzepczu uległ zniszczeniu do tego stopnia, że groził zawaleniem. Pojawiła się zatem konieczność budowy nowego kościoła. Tego zadania podjął się ks. Józef Rotta.
W dniu 13 lipca 1947 roku ksiądz biskup Kazimierz Józef Kowalski poświęcił kamień węgielny pod budowę kościoła.
Natomiast w dniu 24 lipca 1949 roku konsekrował nowo wybudowaną świątynię.
W nowym kościele znajdują dwa barokowe ołtarze, wspomniana już wcześniej łaskami słynąca figura Matki Bożej oraz kilka innych zabytkowych rzeźb i obrazów. W ołtarzu Matki Boskiej znajdują się liczne vota dziękczynne ofiarowane przez wiernych.
Zauważyć należy, że po wojnie został rozebrany założony w czasach Rzeczypospolitej Szlacheckiej strzepski szpital.
W 1970 roku obszar parafii został ponownie zmniejszony poprzez utworzenie parafii w Smażynie.
Od 1945 roku parafią zarządzali następujący proboszczowie:
- Ks. Józef Rotta – w latach 1945 – 1957
- Ks. Franiszek Muller – w latach 1957 -1970
- Ks. Antoni Senkowski – w latach 1970 – 1973
- Ks. Bogusław Szczygieł – w latach 1973 – 1998
- Ks. Kazimierz Kobiela – w latach 1998 – 2001
- Ks. Kazimierz Skwiercz – w roku 2001.
- Obecnie, od roku 2001 proboszczem parafii jest ks. Andrzej Kmiecik.
